Table of Contents - parse_fasta-2.5.2 Documentation
Classes and Modules
- ParseFasta
- ParseFasta::CoreExt
- ParseFasta::CoreExt::String
- ParseFasta::Error
- ParseFasta::Error::ArgumentError
- ParseFasta::Error::DataFormatError
- ParseFasta::Error::FileNotFoundError
- ParseFasta::Error::ParseFastaError
- ParseFasta::Error::SequenceFormatError
- ParseFasta::Record
- ParseFasta::SeqFile
Methods
- ::new — ParseFasta::Record
- ::new — ParseFasta::SeqFile
- ::open — ParseFasta::SeqFile
- #== — ParseFasta::Record
- #check_fasta_seq — ParseFasta::Record
- #check_file — ParseFasta::SeqFile
- #check_qual — ParseFasta::Record
- #each_record — ParseFasta::SeqFile
- #each_record_gzipped — ParseFasta::SeqFile
- #each_record_non_gzipped — ParseFasta::SeqFile
- #fastq? — ParseFasta::Record
- #get_first_char — ParseFasta::SeqFile
- #gzipped? — ParseFasta::SeqFile
- #make_qual_str — ParseFasta::Record
- #parse_fasta_line — ParseFasta::SeqFile
- #parse_fasta_lines — ParseFasta::SeqFile
- #parse_fastq_line — ParseFasta::SeqFile
- #parse_fastq_lines — ParseFasta::SeqFile
- #remove_gaps — ParseFasta::CoreExt::String
- #to_fasta — ParseFasta::Record
- #to_fastq — ParseFasta::Record
- #to_s — ParseFasta::Record
- #which_line_reader — ParseFasta::SeqFile